《那夜凌晨，我坐上了旺角开往大埔的红VAN》的剧情发生在一个平凡的夜晚。主角游梓池与朋友欢聚后，独自乘坐一辆从旺角开往大埔的红色小巴。车子驶入狮子山隧道后，游梓池惊讶地发现，车外的世界突然变得空无一人，只有他们这辆小巴孤独地行驶在空旷的公路上。

随着夜色渐深，神秘事件接踵而至。乘客们开始一个接一个地离奇死亡，每个死亡背后都似乎隐藏着不可告人的秘密。此时，一个头戴防毒面具的神秘人物出现，更增加了整个事件的诡异气氛。

游梓池作为唯一的幸存者，必须解开这一切谜团，找到返回现实世界的方法。他不仅要面对内心的恐惧，还要与那个神秘人物斗智斗勇，最终揭示这一切背后的真相。整个故事充满了悬疑与惊悚，让观众在紧张刺激的氛围中，体验一场前所未有的心灵之旅。