《隐秘生物》的剧情设定在一个远离人类文明的偏远小镇。小镇被浓密的森林环绕，隐藏着不为人知的秘密。故事的主人公是一位年轻的生物学家，他因为对未知生物的好奇心，来到这个小镇进行研究。

随着调查的深入，他发现小镇的居民们似乎都对森林中的某个生物心存敬畏，但又不愿多谈。生物学家决定独自深入森林，探索这个神秘生物的真相。在森林深处，他遇到了一系列诡异而危险的事件，每一次都让他离真相更近一步。

最终，他揭开了这个生物的真面目——一种拥有高度智慧、能与人类沟通的神秘生物。然而，这个生物的存在却引发了人类对自然的贪婪和破坏，小镇的平静被打破，一场人与自然的冲突在所难免。

生物学家在保护这个生物和揭示真相的过程中，也意识到了人类与自然和谐共生的重要性。电影以一场惊心动魄的决战结束，留给观众无尽的思考和感慨。