《布莱泽奥特曼 大电影 大怪兽东京决战》的剧情紧凑且充满张力。故事开篇，怪兽在东京一处工业园内频繁出现，特怪对分队在弦人队长的带领下奋力迎击，但怪兽却如潮水般不断涌现。调查发现，这些怪兽灾害可能与处理怪兽残骸的企业内克洛马斯有关，于是特怪对分队迅速找到该企业的CEO真伏博士。

原来，内克洛马斯研究所正秘密研发一种名为“达姆多可辛”的神秘物质，它触及生命根源，有望实现生物的长生不死。然而，就在研发即将成功之际，自称宇宙霸主的达姆诺星人突然降临，并破坏了“达姆多可辛”的储藏柜。这一变故导致研究所内的怪兽样本被吸收，融合成恐怖的怪兽“妖骸魔兽贡基尔刚”。

随着怪兽的肆虐，东京陷入危机。布莱泽奥特曼挺身而出，与特怪对分队并肩作战，誓要守护这座城市的安宁。一场惊心动魄的决战在东京上空展开，最终布莱泽奥特曼凭借强大的力量和坚定的信念，成功击败怪兽，保护了东京免受灾难的侵袭。