《逆青春第二季》的剧情围绕着五星体院足球班的少年们展开。

程童童是一个在业余球队打杂的少年，因其天赋异禀，一个大脚能将足球踢到令人惊叹的距离，被五星体院足球班新上任的教练任军挖掘，特招进入足球班。在这里，他结识了陈雅静、陈中、尚海瑞等一众好友，并与女神夏雨产生了感情纠葛。童童刻苦钻研，习得足球必杀技，在多次比赛中力挽狂澜，成为足球班的大功臣。

然而，球场风波接踵而至，童童等人被人陷害，误服兴奋剂，全队面临着禁赛的危机。在童童落魄之际，他和夏雨因性格不合最终分道扬镳。面对重重挑战和难关，五星体院足球班的少年们没有放弃，他们勤学苦练，日益精进，为成为中国足球的黑马而不懈努力。

在历经诸多波折之后，童童与好友陈雅静之间渐渐产生了情愫，而陈中、尚海瑞也各自收获了爱情。热血少年们面对不可预知的未来，勇敢逆风奔跑，携手再逆一次青春。