《女生部里的秘密》是一部充满趣味与反转的喜剧电影。故事发生在2012年的美国，主人公莫莉·默瑞丝是一名花季少女，同时也是一名跟随父亲工作的私家侦探。她因一次偶然的机会被联邦调查局选中，接受了一项特殊任务——卧底进入一所大学的女生联谊会。

莫莉的任务是保护一名重要证人，该证人正是联谊会中的一名女大学生。为了完成任务，莫莉必须彻底改变自己的形象，从一名街头智慧的私家侦探转变为举止高雅、时髦成熟的女大学生。在联谊会中，她不仅要应对各种复杂的社交场合，还要与各种性格迥异的成员打交道。

随着调查的深入，莫莉逐渐发现真相远比想象中更加扑朔迷离。她不仅要面对来自外部的挑战，还要应对自己内心的挣扎与成长。最终，在一系列惊险刺激的冒险后，莫莉成功完成了任务，也收获了属于自己的成长与感悟。